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Este estudo revela que a vitrificação de tecidos neurais induz vulnerabilidades transcricionais seletivas e estruturadas, afetando desproporcionalmente genes que codificam proteínas com arquiteturas complexas de membrana e vias secretoras, especialmente no hipocampo, em comparação com o congelamento rápido.
Este estudo demonstra que a pré-amplificação por DLMDA em amostras de DNA de tumores prostáticos FFPE permite uma recuperação robusta de rendimento e evita artefatos falsos positivos em alterações de número de cópia, embora reduza a sensibilidade na detecção dessas alterações, tornando-a viável para triagem genômica, mas exigindo melhorias para minimizar falsos negativos.
Este estudo avalia a estabilidade de longo prazo de 44 nucleosídeos de RNA em solução aquosa, identificando compostos instáveis e propondo diretrizes práticas para armazenamento e controle de qualidade a fim de melhorar a precisão e a comparabilidade das análises de modificações de RNA por LC-MS.
Este estudo demonstra que a plasticidade fenotípica das células musculares lisas vasculares durante a aterosclerose envolve paisagens epitranscriptômicas distintas, nas quais modificações de uridina em mRNAs pro-inflamatórios desempenham um papel crucial na regulação pós-transcricional.
Este estudo demonstra que os padrões de metilação 2'-O do rRNA são altamente semelhantes entre ribossomos citosólicos e associados ao retículo endoplasmático em diferentes tipos celulares humanos, indicando que essa modificação não estabelece uma assinatura específica do ER nem determina a localização ou função dos ribossomos nesse compartimento.
Este estudo demonstra que a enzima KDM2B regula os níveis e a atividade do fator induzível por hipóxia (HIF-1) de maneira dependente do tipo celular, atuando através de seus domínios JmjC e CxxC para recrutar a RNA Polimerase II e promover a expressão gênica e a sobrevivência celular em condições de hipóxia.
Este estudo revela que as proteínas "bicycle" de pulgões, que induzem a formação de galhas em plantas, possuem dobras semelhantes a saposinas e evoluíram rapidamente, diversificando suas estruturas e propriedades físico-químicas para evadir o sistema imunológico vegetal ou atingir alvos diversos.
Este estudo revela que a infecção pelo vírus Zika remodela o epitranscriptoma do hospedeiro ao induzir poliadenilação não canônica, gerando novos isoformas de RNA que são preferencialmente metilados por METTL3, resultando em alterações específicas de m6A que afetam vias de sinalização imune.
Este estudo demonstra que o crosstalk de barcodes em sequenciamento ONT, especialmente crítico em amostras com baixa concentração de DNA, pode ser significativamente reduzido pela atualização do protocolo de lavagem da Oxford Nanopore e eliminado quase totalmente por meio de uma estratégia de laboratório que realiza o agrupamento das amostras apenas após a ligação do adaptador de sequenciamento.
Este estudo demonstra que o complexo de remodelação de cromatina NuRD é essencial para o "reset" de enhancers em células-tronco embrionárias de camundongos, um processo de duas fases desencadeado pelo sinalização ERK que permite a troca dinâmica de fatores de transcrição e a reestabelecimento de um estado de cromatina estável, facilitando assim respostas transcricionais rápidas e precisas durante a diferenciação celular.
Este artigo descreve a expansão e otimização do sistema AID2 para degradação induzível de auxina em patógenos do gênero *Candida*, incluindo a criação de novos vetores para cepas prototróficas e clínicas de *C. albicans*, o desenvolvimento de estratégias de marcação N-terminal e de cassetes "tudo-em-um" para engenharia genética simplificada, e a validação da eficácia do sistema em *C. auris*.
Este trabalho apresenta um dispositivo híbrido de papel e polímero impresso em 3D que utiliza uma porta lógica de DNA baseada em deslocamento de cadeia mediado por toehold para detectar com alta sensibilidade e especificidade o fator de crescimento derivado de plaquetas BB (PDGF BB) através de fluorescência, visando o diagnóstico de pré-eclâmpsia precoce.
Este estudo investiga as interações moleculares e conformacionais entre o riboswitch SAM-I e seus ligantes (SAM, SAH e o candidato JS4) por meio de simulações, fornecendo insights cruciais para o desenvolvimento de novos antibióticos que visam o RNA.
A vitamina D3 atenua a toxicidade dérmica induzida por mostarda nitrogenada ao remodelar a microbiota intestinal, promovendo a produção de butirato via a via de sinalização VDR-α-defensina no intestino, o que sugere que a modulação da flora intestinal ou a suplementação com butirato são terapias potenciais para essa condição.
Este estudo identifica uma mutação na estrutura de alça do pré-miR-3260 em uma linhagem de bicho-da-seda (*Bombyx mori*) com pele larval translúcida, demonstrando que, apesar de a mutação impedir o processamento pelo Dicer, ela não afeta a atividade de clivagem nem induz fenótipos relacionados ao hormônio juvenil, sugerindo que alterações nessa região não impactam significativamente a função do miRNA.
Este estudo realiza uma análise genômica abrangente da família de genes HMA no feijão-de-mungo, identificando nove membros, caracterizando suas estruturas e domínios, e demonstrando, através de análise de expressão sob estresse por Zn, Cd e Cu, que o gene VrHMA5 desempenha um papel crucial no transporte vascular e na homeostase de metais.
Este estudo demonstra que o estolamento ribossomal, que ocorre preferencialmente quando os peptídeos de trânsito emergem do túnel de saída, atua como um mecanismo regulador essencial para promover a eficiência do direcionamento de proteínas codificadas no núcleo para os cloroplastos em Arabidopsis thaliana.
Este estudo demonstra que a remodelação da célula hospedeira mediada por quinases dependentes de ciclina, especialmente a CDK2, é essencial para a replicação e transcrição do vírus Ebola, sugerindo que a inibição dessas vias de sinalização representa uma estratégia antiviral promissora.
Este estudo identifica variantes regulatórias associadas à doença de Parkinson em neurônios dopaminérgicos humanos, demonstrando que alelos de risco nos loci SCARB2 e BAG3 reduzem a expressão gênica ao alterar a acessibilidade da cromatina e a ligação de fatores de transcrição, fornecendo assim novos insights mecanísticos sobre a patologia da doença.
Este estudo caracteriza o transcriptoma mitocondrial do zebrafish, identificando a lncRNA lncOriL e outras transcrições atípicas, e demonstra que essas descobertas são conservadas em diversos peixes e também em mamíferos, incluindo humanos, sugerindo uma expressão ubíqua e regulada em vertebrados.